Twist Bioscience
RNA kontroller for respiratoriske assay
Twist Respiratory Virus Controls utgjør et bredt spekter av viktige RNA- og DNA-virus som er relevante for forskning på luftveissykdommer. De muliggjør undersøkelser av biologien til et bredt spekter av virus ved bruk av NGS og qPCR. Inkludert i panelet er et utvalg av varianter med omfattende dekning av full-lengde syntetiske virussekvenser, noe som gjør det mulig å skille mellom viktige smittestoffer.
Syntetiske kontroller er gode alternativer til "levende virus", som krever skjør håndtering av prøver fra en infisert pasient eller fra levende virus dyrket i cellekultur. Syntetiske kontroller skapt gjennom gensyntese utvider tilgangen på tvers av ulike stammer samtidig som de reduserer bekymringer for sikkerhet.
- Positive kontroller som er kompatible med både qPCR- og NGS-baserte tester, kan brukes som negative kontroller for rutinemessige SARS-CoV-2-tester.
- Kan være nyttige for identifisering av patogener med lignende symptomer, som SARS-CoV-2
- Dekker et bredt spekter av luftveisvirus
- Fullstendig syntetisk RNA og DNA generert fra Twist-genfragmenter
- >99,9% dekning av viralt genom
- NGS-sekvens verifisert
Hver RNA-kontroll genereres ved syntese av enkelt eller multiple DNA-fragmenter som transkriberes til ssRNA. ssDNA-viral kontrollen blir deretter enzymatisk avledet fra ssRNA. Hver kontroll gir genomdekning på >99,9% og leveres i et volum på 100 μL med en konsentrasjon på omtrent én million kopier per mikroliter.
Kat. nr. | Produkt | Accession | Virustype | Lengde (baser) |
---|---|---|---|---|
103001 | Twist Synthetic Influenza H1N1 (2009) RNA control | NC_026431, NC_026432, NC_026433, NC_026434, NC_026435, NC_026436, NC_026437, NC_026438 | ssRNA (- sense) |
13158 |
103002 | Twist Synthetic Influenza H3N2 RNA control | NC_007366, NC_007367, NC_007368, NC_007369, NC_007370, NC_007371, NC_007372, NC_007373 |
ssRNA (- sense) |
13627 |
103003 | Twist Synthetic Influenza B RNA control | NC_002204, NC_002205, NC_002206, NC_002207, NC_002208, NC_002209, NC_002210, NC_002211 |
ssRNA (- sense) |
14452 |
103004 | Twist Synthetic Human bocavirus 1 DNA control | MG953830.1 | ssDNA | 5164 |
103005 | Twist Synthetic Human enterovirus 68 RNA control | NC_038308.1 | ssRNA (+ sense) |
7367 |
103006 | Twist Synthetic Human rhinovirus 89 RNA control | NC_001617.1 | ssRNA (+ sense) |
7152 |
103007 | Twist Synthetic Mumps virus RNA control | NC_002200.1 | ssRNA (- sense) |
15384 |
103008 | Twist Synthetic Human parainfluenza virus 1 RNA control | NC_003461.1 | ssRNA (- sense) |
15600 |
103009 | Twist Synthetic Measles virus RNA control | NC_001498.1 | ssRNA (- sense) |
15894 |
103010 | Twist Synthetic Human parainfluenza virus 4 RNA control | NC_021928.1 | ssRNA (- sense) |
17052 |
103011 | Twist Synthetic Human coronavirus 229E RNA control | NC_002645.1 | ssRNA (+ sense) |
27317 |
103012 | Twist Synthetic Human coronavirus NL63 RNA control | NC_005831.2 | ssRNA (+ sense) |
27553 |
103013 | Twist Synthetic Human coronavirus OC43 RNA control | NC_006213.1 | ssRNA (+ sense) |
30741 |
103730 | Twist Respiratory Virus Controls (13 Count) | N/A | N/A | N/A |
Tabell 1. Virusnavn GenBank-ID-er, virus type og lengde for hvert virus inkludert i Twist Respiratory Virus Controls.